Dự án Luật thuế GTGT: Nhiều vướng mắc trong lĩnh vực nông nghiệp đã được tháo gỡ

Cho phép khấu trừ thuế GTGT đối với hàng nông sản

Tại phiên họp Quốc hội chiều 4/12, Bộ trưởng Bộ Tài chính Nguyễn Văn Thắng cho biết, ngay sau khi Luật Thuế GTGT (Luật số 48/2024/QH15) có hiệu lực (từ ngày 1/7/2025), Chính phủ, Bộ Tài chính đã nhận được nhiều kiến nghị, phản ánh của hiệp hội và doanh nghiệp về vướng mắc của chính sách thuế GTGT đối với lĩnh vực nông nghiệp, thức ăn chăn nuôi và hoàn thuế GTGT.

Để giải quyết các vướng mắc, bất cập từ thực tiễn, tháo gỡ các điểm nghẽn do nguyên nhân từ quy định pháp luật như tinh thần Nghị quyết số 66-NQ/TW của Bộ Chính trị, đặc biệt trong bối cảnh cả nước đang chịu hậu quả thiên tai, bão lũ…, cần khẩn trương phục hồi hoạt động sản xuất, kinh doanh, nhất là lĩnh vực nông nghiệp, Chính phủ cho rằng, cần thiết phải sửa đổi ngay một số quy định của Luật Thuế GTGT.

Theo đó, đưa lại nội dung đã được quy định từ năm 2014 về việc doanh nghiệp, hợp tác xã, liên hiệp hợp tác xã không phải tính thuế GTGT, nhưng được khấu trừ thuế GTGT đầu vào khi bán sản phẩm cây trồng, rừng trồng, chăn nuôi, thủy sản nuôi trồng, đánh bắt chưa chế biến thành các sản phẩm khác hoặc chỉ qua sơ chế thông thường cho doanh nghiệp, hợp tác xã, liên hiệp hợp tác xã khác.

Bộ trưởng Nguyễn Văn Thắng cho biết, quy định này đã được thực hiện ổn định nhiều năm, đảm bảo không vi phạm nguyên tắc của thuế GTGT, đồng thời không làm ảnh hưởng đến số thu ngân sách nhà nước. Bên cạnh đó sẽ góp phần giảm bớt gánh nặng về thủ tục hành chính cho doanh nghiệp, đồng thời góp phần hỗ trợ hoạt động sản xuất nông, lâm, thủy, hải sản khi doanh nghiệp không phải ứng trước tiền để nộp thuế, sau đó lại làm thủ tục hoàn thuế, tránh lãng phí thời gian và chi phí cơ hội của doanh nghiệp.

Theo số liệu báo cáo, các doanh nghiệp ngành cà phê phải ứng ra khoảng 5.000 tỷ đồng, ngành lương thực khoảng 2.016 tỷ đồng, ngành hồ tiêu và cây gia vị khoảng 2.162 tỷ đồng mỗi năm để nộp thuế GTGT.

Áp dụng thuế GTGT đồng bộ theo quy định của pháp luật

Nội dung sửa đổi thứ hai là lược bỏ nội dung sản phẩm cây trồng, rừng trồng, chăn nuôi, thủy sản nuôi trồng, đánh bắt chưa chế biến thành các sản phẩm khác hoặc chỉ qua sơ chế thông thường được sử dụng làm thức ăn chăn nuôi, dược liệu thì áp dụng thuế suất GTGT theo mức thuế suất quy định cho sản phẩm cây trồng, rừng trồng, chăn nuôi, thủy sản đang quy định tại Khoản 5 Điều 9 Luật Thuế GTGT.

Cả 3 vấn đề đều được đề xuất sửa đổi theo hướng có lợi cho người dân, doanh nghiệp. Các nội dung chính sách không có hạn chế về quyền, phù hợp với Hiến pháp và đều có lợi cho người nộp thuế, đặc biệt là cho người nông dân. Do đó, thay vì áp dụng Nghị quyết số 206/2025/QH15 để tháo gỡ vướng mắc tạm thời, việc sửa đổi Luật theo quy trình rút gọn ngay tại Kỳ họp này chính là để các quy định về thuế được bền vững,

Việc này nhằm đảm bảo áp dụng thuế GTGT đồng bộ theo quy định của pháp luật về thức ăn chăn nuôi, đảm bảo bình đẳng với thức ăn chăn nuôi nhập khẩu, vốn không phải chịu thuế. Nếu giữ như quy định tại Khoản 5 Điều 9 Luật Thuế GTGT nêu trên, thì thức ăn chăn nuôi sản xuất trong nước có thuế GTGT đầu vào là 5%, phải tính vào chi phí do bán ra không chịu thuế GTGT

. "Qua đó, tháo gỡ khó khăn cho sản xuất nông nghiệp, nhất là trong bối cảnh nông nghiệp bị ảnh hưởng nhiều từ hậu quả của thiên tai, lũ lụt kéo dài" - Bộ trưởng Nguyễn Văn Thắng nêu rõ.

Lược bỏ quy định về điều kiện hoàn thuế

Chính phủ cũng đề xuất lược bỏ quy định về điều kiện hoàn thuế là người mua chỉ được hoàn thuế khi người bán đã kê khai hoàn thuế. Trước đó, khi sửa luật vào năm 2024,. Quy định này được xác định là một trong những giải pháp để quản lý thuế nhằm phòng chống gian lận trong hoàn thuế trong khi chưa sửa đổi các quy định về quản lý thuế.

Tuy nhiên, hiện nay, dự thảo Luật Quản lý thuế sửa đổi đang trình Quốc hội thông qua tại kỳ họp này đã bổ sung các quy định nhằm quản lý thuế chặt chẽ hơn đối với người nộp thuế để đảm bảo thu đúng, thu đủ tiền thuế vào ngân sách nhà nước và quản lý chặt chẽ hơn trong hoàn thuế cũng như trong công tác kiểm tra người nộp thuế. Do vậy, Chính phủ đề nghị không quy định nội dung này tại Luật Thuế GTGT và việc kiểm tra, giám sát hoàn thuế được thực hiện thống nhất theo quy định của Luật Quản lý thuế.

Thảo luận tại phiên họp, các thành viên Ủy ban Thường vụ Quốc hội nhất trí với việc cần thiết sửa đổi Luật và các nội dung cụ thể Chính phủ trình.

Kết luận phiên họp, Phó Chủ tịch Quốc hội Nguyễn Đức Hải cho biết, Ủy ban Thường vụ Quốc hội thống nhất trình Quốc hội xem xét quyết định dự án Luật sửa đổi bổ sung một số điều Luật Thuế GTGT theo trình tự thủ tục rút gọn.